2009年1月，《北京轨道交通昌平线一期工程总体设计》通过评审，同年4月2日，北京地铁昌平线一期（西二旗-南邵站）工程开工建设，位于昌平区回龙观地区、北清路和京藏高速公路相交的辛庄桥西侧、中关村生命科学园东南方向的生命科学园站同步启动建设。
此后20年间，生命科学园“物理轨道”与“创新轨道”发展齐头并进，共同开启昌平生物医药产业发展新篇章。
2019年，是生命科学园园区发展的转折之年。“市区统筹、以区为主” 的管理体制正式确立，飞镖、新生巢等专业运营力量引入，未来科学城管委会加挂 “生命园管委会”牌子。从管理架构的优化、运营模式的创新到空间规划的完善，生命科学园的“轨道”基础逐步夯实，为产业加速跑做好了充分铺垫。
百济神州自主研发的泽布替尼胶囊，在全球市场表现卓越，年销售额突破30亿美元。这款药物适用于治疗既往至少接受过一种治疗的成人套细胞淋巴瘤、慢性淋巴细胞白血病、小淋巴细胞淋巴瘤以及华氏巨球蛋白血症等患者。凭借出色的疗效，泽布替尼成功进入美欧日临床指南，成为首个获此殊荣的“中国原研药”。
诺诚健华抗肿瘤创新药物生产基地项目纳入市级“3个100”、两区重点项目、区级重大星空体育智能科技项目，其研发的多项抗肿瘤药物已获批上市，佐来曲替尼（ICP-723）有望成为中国首个自主研发获批上市的TRK抑制剂。
健达九州的GA001基因疗法，堪称视障患者的福音。自2024年1月开展临床试验，完成首例受试者给药后，已顺利完成全部9例受试者给药。试验结果令人振奋，大部分受试者视力显著改善，部分患者甚至能够识别近距离字母和图案，为遗传性眼病治疗领域开辟了新路径。
这些先进技术的突破，不仅填补了国内空白，更让中国生物医药从“跟跑”走向“并跑”乃至“领跑”，在全球生物医药竞争格局中占据了重要一席之地。
此外，中关村合成生物制造产业集聚区初具规模，搭建共性技术平台13个、集聚企业123家，占全市的半壁江山，推动丹纳赫落地首个在京实体创新中心，服务微元合成成为全国首家获批生物制造阿洛酮糖企业、入选工信部第一批“生物制造标志性产品”名单，齐禾生科摘得中国首张主粮基因编辑安全证书，打造产业创新主峰、生态高地。
2000年初建时，生命科学园无公交、少出租，员工通勤靠拼车，天黑后园区周边冷清。20多年间，这里一步步打破 “产业孤岛” 困境，昌61路、62路等线路开通并延伸至园区。
昌平线生命科学园站开通并南延，与8号线相连，让通勤时间大幅缩短，北清路快速化改造路段全线通车，进一步改善交通条件，通勤从 “多站换乘” 变为 “家门口直达”。
北清路快速化改造路段已全线年那时候员工通勤特别麻烦。一开始是拼车，后来得倒好几趟公交才能到园区，像辛庄桥这些站点，都是我们以前经常倒车的地方。再后来有些员工自己买了车，不过遇到限行的时候，还是得坐公交车。”北京飞镖国际创新中心副总经理江茂华表示，现在公交、地铁线路都多了起来，很多员工从家出门，不用倒车就能直接到园区，比以前省了不少时间。
交通的便利只是吸引人才的一方面，真正让科研人员扎堆入驻的，是园区所构建的完整创新生态。
这里汇聚了千余家生物医药科技企业。园区有高博医院、北大国际医院、北大六院等一批研究型医院，有北京飞镖国际创新中心、新生巢等一批标杆孵化器，有59个生物医药共性技术服务平台，生命科学园里可以说是“什么都有”，在这里科研创业，科研工作者们只需专注创新，其余就交给专业团队。这样既能让科学家保持科研纯粹性，又能让成果加快落地。
与此同时，北京一六一中学回龙观学校（生命园校区）今年九月正式开始招生，作为服务区域发展的教育配套，该校区招生重点辐射周边园区企业，切实解决科技人才子女入学问题。
除已运营的地铁昌平线号线北延、市郊铁路东北环线规划已提上日程，未来将增设“生命谷站”，实现地铁线路直通园区核心区域。这一轨道升级将彻底打通园区北至清华南口国重基地、南至大兴相关产业园区以及中心城区、周边产业片区的交通脉络，科研人员到海淀、朝阳等中心区域通勤时间将大幅缩短，跨区域开展技术合作、学术交流也将更加高效。
为了从根本上解决传统城市发展模式所带来的低效、疲累的通勤问题，真正实现“产城融合”“站城融合”，园区将依托《中关村生命科学园三期市政交通及公服配套设施行动计划（2024-2027年）》，推进多项配套项目建设，完善居住、商业、公服功能，实现“科学+城”的深度融合，为产业发展提供更优质的空间保障。
生命科学园三期的加速建设，以及生命科学创新走廊的“一核一带三片区”同步发力，昌平正构建更加庞大的集医疗器械、美丽经济、合成生物制造等产业集聚的产业空间，将形成“创新研发在生命园、成果转化在走廊”的良性循环。
地铁19号线北延、市郊铁路东北环线的建设，将打通昌平以科教融合引领、产学研协同发展的京藏高速（G6）科创走廊的轨道网，串联起中关村生命科学园、朱辛庄数智创新港、未来大学科技园及各大学科技园区、国家工程技术创新基地、沙河医药健康产业园、机器人产业园、国际医疗器械城、北大产教研融合创新中心、清华南口国重基地及清华昌平科研基地等10多个创新组团。
“轨道上的昌平”这一发展脉络，凭借交通优势汇聚全球创新资源，依托创新成果提升产业竞争力，完善产业生态吸引更多优质企业与人才，在生命科学领域持续领航，为全球生命健康事业发展贡献更多“昌平力量”。
